root/applications/bdmtoolbox/mex/mexBM.cpp @ 390

Revision 374, 2.9 kB (checked in by miro, 15 years ago)

mexBM works. An example added (it ignores any underlying theory).
config2mxstruct probably doesn't handle vectors and matrices, to be fixed

Line 
1#include <itpp/itmex.h>
2#include <estim/arx.h>
3#include "config2mxstruct.h"
4
5using namespace bdm;
6
7class mexEpdf: public epdf{
8        protected:
9                string name;
10                mxArray *data;
11        public:
12                mexEpdf() {};
13                void from_setting(const Setting &S)  {
14                        name = (const char *) S["name"];
15                        UImxConfig conf(S);
16                        data = mxDuplicateArray(conf.mxconfig);
17                        //mexCallMATLAB(1, &data, 0, 0, (name+"_new").c_str());
18                        //TODO (future...):
19                        //mxArray * init_data = setting2mxarray S["init_data"];
20                        //mexCallMATLAB(1, &data, 1, &init_data, name+"_from_setting");
21                        //delete init_data;
22                } 
23                vec mean() const {
24                        mxArray *tmp;
25                        string fname = name+"_mean";
26                        mexCallMATLAB(1, &tmp, 1, (mxArray **) &data, fname.c_str());
27                        return mxArray2vec(tmp);
28                } 
29};
30
31class mexBM: public BM{
32        protected :
33                string name;
34                mexEpdf est;
35                mxArray *data;
36        public:
37                mexBM() {}
38
39                mxArray *get_data() {
40                        //mexCallMATLAB(0, NULL, 1, &data, "dump");
41                        return mxDuplicateArray(data);
42                }
43
44                void from_setting(const Setting &S)  {
45                        name = (const char *) S["name"];
46                        UImxConfig conf(S);
47                        data = mxDuplicateArray(conf.mxconfig);
48                        //string fname = name+"_new";
49                        //mexCallMATLAB(1, &data, 0, 0, (name+"_new").c_str());
50                        //the following works as long as the posterior is the
51                        //only member object there could be a structure of
52                        //member objects in the setting and a for cycle over
53                        //all of them right here in the code
54                        Setting &posterior = S["posterior"]; 
55                        est.from_setting(posterior);
56                }
57                void bayes(const vec &dt)  {
58                //void bayes()  {
59                        mxArray *tmp, *old;
60                        mxArray *in[2];
61                        in[0] = data;
62                        in[1] = mxCreateDoubleMatrix(dt.size(), 1, mxREAL);
63                        vec2mxArray(dt, in[1]);
64                        mexCallMATLAB(1, &tmp, 2, in, (name+"_bayes").c_str());
65                        old = data;
66                        data = mxDuplicateArray(tmp);
67                        if (old) mxDestroyArray(old);
68                        if (tmp) mxDestroyArray(tmp);
69                        //mexCallMATLAB(0, NULL, 1, &data, "dump");
70                } 
71                const mexEpdf& posterior() const  {
72                        return est;
73                } //tohle by melo zustat!!
74                const mexEpdf* _e() const  {
75                        return &est;
76                } //tohle by melo zustat!!
77};
78
79void mexFunction(int n_output, mxArray *output[], int n_input, const mxArray *input[])
80{
81    // Check the number of inputs and output arguments
82        if(n_input!=1) mexErrMsgTxt("Wrong number of input variables - expected parameter 'filename'!");
83
84        // ------------------ Start of routine ---------------------------
85
86        //mexBM mB(mxArray2string(input[0])); // naplni
87        //mB.bayes(vec_1(1.3));
88        string filename = mxArray2string(input[0]);
89        Config config;
90        config.readFile(filename.c_str());
91        mexBM mb;
92        Setting &root = config.getRoot();
93        mb.from_setting(root);
94        vec dt = "18.0";
95        mb.bayes(dt);
96        if(n_output>0) output[0] = mb.get_data();
97       
98
99        // ------------------ End of routine -----------------------------
100
101    // Create output vectors
102        //output[0] = mxCreateDoubleMatrix(1,1, mxREAL);
103
104    // Convert the IT++ format to Matlab format for output
105        //vec2mxArray(mB.posterior().mean(), output[0]);
106}
Note: See TracBrowser for help on using the browser.