root/applications/robust/robustlib.cpp @ 1320

Revision 1320, 7.9 kB (checked in by sindj, 13 years ago)

Rozdelano samplovani z emlig. Zbyva dodelat vypocet v jednotlivych simplexech triangulace. JS

RevLine 
[976]1#include "robustlib.h"
2
[1282]3
[1254]4void polyhedron::triangulate(bool should_integrate)
[1273]5        {
[1301]6                triangulation.clear();
[1299]7
[1271]8                if(should_integrate)
9                {
10                        ((toprow *)this)->probability = 0.0;
11                }               
12               
[1301]13                if(vertices.size()==1)
14                {
15                        set<vertex*> vert_simplex;
16                        vert_simplex.insert((vertex*)this);
17
[1320]18                        triangulation.insert(pair<double,set<vertex*>>(0,vert_simplex));
[1301]19                }
20
[1254]21                for(list<polyhedron*>::iterator child_ref = children.begin();child_ref!=children.end();child_ref++)
[1271]22                {                       
[1320]23                        for(map<double,set<vertex*>>::iterator t_ref = (*child_ref)->triangulation.begin();t_ref!=(*child_ref)->triangulation.end();t_ref++)
[1254]24                        {
25                                set<vertex*> new_simplex;
[1320]26                                new_simplex.insert((*t_ref).second.begin(),(*t_ref).second.end());                             
[1301]27
28                                pair<set<vertex*>::iterator,bool> ret_val = new_simplex.insert(*vertices.begin());
29
30                                if(ret_val.second == true)
31                                {
[1320]32                                        double cur_prob = 0;
[1301]33
34                                        if(should_integrate)
35                                        {
[1320]36                                                cur_prob = ((toprow *)this)->integrate_simplex(new_simplex, 'S');
37
38                                                ((toprow *)this)->probability += cur_prob;
[1301]39                                        }
[1320]40
41                                        triangulation.insert(pair<double,set<vertex*>>(cur_prob,new_simplex));
[1301]42                                } 
43                        }       
44                }               
45               
46                /*
47                for(list<polyhedron*>::iterator child_ref = children.begin();child_ref!=children.end();child_ref++)
48                {                       
49                        for(list<set<vertex*>>::iterator t_ref = (*child_ref)->triangulation.begin();t_ref!=(*child_ref)->triangulation.end();t_ref++)
50                        {
51                                set<vertex*> new_simplex;
[1299]52                                new_simplex.insert((*t_ref).begin(),(*t_ref).end());                   
[1254]53
[1299]54                                for(set<vertex*>::iterator suitable_vert_ref = vertices.begin();*suitable_vert_ref<*(*t_ref).begin();suitable_vert_ref++)
55                                {
[1301]56                                        set<vertex*> suitable_simplex;
57                                        suitable_simplex.insert(new_simplex.begin(),new_simplex.end());
58                                       
59                                        suitable_simplex.insert(*suitable_vert_ref);
[1254]60
[1301]61                                        triangulation.push_back(suitable_simplex);
[1254]62
[1271]63                                        if(should_integrate)
[1254]64                                        {
[1301]65                                                ((toprow *)this)->probability += ((toprow *)this)->integrate_simplex(suitable_simplex, 'S');
[1271]66                                        }
[1299]67                                }                               
[1271]68                        }       
[1301]69                }*/             
[1271]70        }
[1268]71
72
[1271]73        double toprow::integrate_simplex(set<vertex*> simplex, char c)
74        {
[1282]75                // cout << ((toprow*)this)->condition << endl;         
76
[1280]77                int condition_order = ((toprow*)this)->condition_order-2; // -2 by bylo, pokud chceme uniformni apriorno
[1254]78
[1280]79                int sigma_order = condition_order-my_emlig->number_of_parameters;
80
[1271]81                // cout << "C:" << condition_order << "  N:" << my_emlig->number_of_parameters << "  C+N:" << condition_order-my_emlig->number_of_parameters << endl;
82                // pause(0.1);
[1254]83
[1280]84                if(sigma_order >= 0)
[1271]85                {
[1275]86
[1282]87                        //cout << endl;
88                        //cout << ((toprow*)this)->condition << endl;
89                        //cout << "C:" << condition_order+2 << "  N:" << my_emlig->number_of_parameters << "  C+N:" << condition_order-my_emlig->number_of_parameters+2 << endl;
90                       
[1275]91
[1271]92                        emlig* current_emlig;
[1254]93
[1271]94                        if(this->my_emlig!=NULL)
95                        {
96                                current_emlig = this->my_emlig;
97                        }
98                        else
99                        {
100                                throw exception("The statistic of the polyhedron you are trying to integrate over doesn't belong to any emlig!");
101                        }                                               
[1254]102
[1271]103                        toprow* as_toprow = (toprow*)this;
[1254]104
[1300]105                        vec cur_condition = as_toprow->condition_sum.get(1,as_toprow->condition_sum.size()-1);
[1254]106
[1275]107                        // cout << as_toprow->condition << endl;                       
[1272]108
[1271]109                        int dimension = simplex.size()-1;
[1254]110
[1275]111                        mat jacobian(dimension,dimension);                     
[1254]112
[1275]113                        double a_0;
[1271]114                        map<double,int> as;
[1275]115                        vertex* base_vertex;
116                        set<vertex*>::iterator base_ref = simplex.begin();
117                        bool order_correct;
118                                               
[1254]119
[1275]120                        do
[1271]121                        {
[1275]122                                order_correct = true;
123                                as.clear();
[1268]124
[1275]125                                base_vertex = (*base_ref);
[1268]126
[1282]127                       
[1301]128                                // cout << endl << "Base coords:" << base_vertex->get_coordinates() << endl;
[1254]129
[1300]130                                a_0 = base_vertex->get_coordinates()*cur_condition-as_toprow->condition_sum[0];
[1282]131                               
[1281]132
[1275]133                                int row_count = 0;
134                                for(set<vertex*>::iterator vert_ref = simplex.begin(); vert_ref!=simplex.end();vert_ref++)
[1271]135                                {
[1275]136                                        if(vert_ref != base_ref)
137                                        {
[1276]138                                                vec relative_coords = (*vert_ref)->get_coordinates()-base_vertex->get_coordinates();                                           
[1275]139
140                                                jacobian.set_row(row_count,relative_coords);
141
[1281]142                                                double new_a = -relative_coords*cur_condition;
[1275]143
[1276]144                                                if(new_a + a_0 == 0 || new_a == 0)
[1275]145                                                {
146                                                        base_ref++;
147
148                                                        if(base_ref == simplex.end())
149                                                        {
150                                                                throw new exception("Equal local conditions are paired. If this ever occurs, the software has to be modified to include multiplied a_0!!");
151                                                        }
152                                                       
153                                                        order_correct = false;                                         
154
155                                                        break;
[1282]156                                                }                                               
157                                               
158                                               
159
160                                                if(a_0<current_emlig->likelihood_value)
161                                                {
162                                                        current_emlig->minimal_vertex = base_vertex;
163                                                        current_emlig->likelihood_value = a_0;
[1275]164                                                }
[1282]165
[1300]166                                                double a_m = (*vert_ref)->get_coordinates()*cur_condition-as_toprow->condition_sum[0];
[1282]167                                                if(a_m<current_emlig->likelihood_value)
168                                                {
169                                                        current_emlig->minimal_vertex = (*vert_ref);
170                                                        current_emlig->likelihood_value = a_m;                                         
171                                                }
172
173                                                //cout << "a0:" << a_0 << " a0 coords:" << base_vertex->get_coordinates() << " am:" << a_m << " am coords:" << (*vert_ref)->get_coordinates() << endl;
174
[1301]175                                                // cout << "Absolute coords:(V"  << row_count << ")" << (*vert_ref)->get_coordinates() << endl;
[1282]176                                                //cout << "Relative coords:(V"  << row_count << ")" << relative_coords << endl;
[1275]177
178                                                pair<map<double,int>::iterator,bool> returned = as.insert(pair<double,int>(new_a,1));
179                                                if(returned.second == false)
180                                                {
181                                                        (*returned.first).second++;
182                                                }
183                                                /*
184                                                else
185                                                {
186                                                        cout << "a[" << row_count << "] = " << new_a << endl;
187                                                }
188                                                */
189                                               
190                                                //as.ins(as.size(),new_a);                                                     
191                                               
192                                                row_count++;
193                                        }
[1271]194                                }
195                        }
[1275]196                        while(!order_correct);
[1272]197                       
[1282]198                        /*
[1281]199                        cout << "a_0: " << a_0 << "    ";
200                        int as_count = 1;
201                        for(map<double,int>::iterator as_ref = as.begin();as_ref!=as.end();as_ref++)
202                        {
203                                cout << "a_" << as_count << ": " << (*as_ref).first << "    ";
204                                as_count++;
[1282]205                        }*/
[1269]206
[1271]207                        double int_value = 0;
[1268]208
[1271]209                        // cout << jacobian << endl;
[1268]210
[1272]211                        double det_jacobian    = abs(det(jacobian));
212                        double correction_term = det_jacobian;                 
[1271]213                        for(map<double,int>::iterator as_ref = as.begin();as_ref!=as.end();as_ref++)
214                        {
[1275]215                                double multiplier = det_jacobian;                               
[1272]216                               
[1275]217                                int as1_order = (*as_ref).second;
218                               
[1280]219                                correction_term /= pow(-(*as_ref).first,as1_order);                                     
[1275]220                               
221                                current_emlig->set_correction_factors(as1_order);
222
223                                vector<double> factors;
224                                int number_of_factors = 0;                                                             
225                                for(map<double,int>::iterator as2_ref = as.begin();as2_ref!=as.end();as2_ref++)
[1272]226                                {
227                                       
[1275]228                                        if(as2_ref!=as_ref)
229                                        {                                                                               
230                                                for(int k = 0;k<(*as2_ref).second;k++)
[1271]231                                                {
[1275]232                                                        factors.push_back((*as_ref).first-(*as2_ref).first);
[1272]233                                                }
[1270]234
[1275]235                                                multiplier        /= pow((*as_ref).first-(*as2_ref).first,(*as2_ref).second);
236                                                number_of_factors += (*as2_ref).second;
237                                        }
238                                        else
[1271]239                                        {
[1275]240                                                factors.push_back((*as_ref).first);
[1270]241
[1275]242                                                multiplier        /= (*as_ref).first;
243                                                number_of_factors += 1;
[1272]244                                        }
[1275]245                                       
[1280]246                                }       
[1254]247
[1280]248                               
249
[1281]250                                double bracket = fact(sigma_order)/fact(as1_order-1)/pow(a_0-(*as_ref).first,sigma_order+1);
[1275]251                                for(int k = 0;k < as1_order-1;k++)
252                                {
[1281]253                                        double bracket_factor = -pow((double)-1,k+1)*fact(sigma_order-k)/fact(as1_order-1-k)/pow(a_0-(*as_ref).first,sigma_order-k);
[1272]254                                       
[1280]255                                        ivec control_vec = ivec();
256                                        control_vec.ins(0,my_emlig->number_of_parameters-as1_order+1);         
257                                       
258                                       
259                                        for(multiset<my_ivec>::iterator combi_ref = this->my_emlig->correction_factors[k].begin();combi_ref!=this->my_emlig->correction_factors[k].upper_bound(my_ivec(control_vec));combi_ref++)
[1275]260                                        {
261                                                double bracket_combination = 1;
[1280]262                                                for(int j = 0;j<(*combi_ref).size();j++)
[1275]263                                                {
[1281]264                                                        //cout << "Factor vector:" << (*combi_ref) << endl;
[1280]265                                                       
266                                                        bracket_combination /= factors[(*combi_ref)[j]-1];
[1275]267                                                }
[1254]268
[1275]269                                                bracket+=bracket_factor*bracket_combination;                                                                   
270                                        }                                                                       
[1271]271                                }
[1275]272
273                               
274
275                                int_value += multiplier*bracket;
276                                                                                                                                               
[1272]277                        }
[1271]278
[1272]279                       
[1281]280                        correction_term *= fact(sigma_order)/abs(pow(a_0,sigma_order+1));
[1271]281
[1272]282                        // cout << c << int_value << endl;
283
284                        int_value += correction_term;
[1275]285               
[1272]286
[1282]287                        //cout << "Probability:" << int_value << endl;
[1275]288                       
289                        return int_value;
[1272]290
[1271]291                       
[1275]292                       
[1271]293                }
294                else
295                {
296                        return 0.0;
297                }
[1254]298        }
Note: See TracBrowser for help on using the browser.