root/doc/xml/linefit2_8cpp.xml @ 187

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2<doxygen xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="compound.xsd" version="1.5.6">
3  <compounddef id="linefit2_8cpp" kind="file">
4    <compoundname>linefit2.cpp</compoundname>
5    <includes local="no">itpp/itmex.h</includes>
6    <includes refid="arx_8h" local="yes">../../bdm/estim/arx.h</includes>
7    <incdepgraph>
8      <node id="530">
9        <label>libBM.h</label>
10        <link refid="libBM_8h"/>
11        <childnode refid="528" relation="include">
12        </childnode>
13      </node>
14      <node id="526">
15        <label>itpp/itmex.h</label>
16      </node>
17      <node id="533">
18        <label>../itpp_ext.h</label>
19        <link refid="itpp__ext_8h-source"/>
20        <childnode refid="528" relation="include">
21        </childnode>
22      </node>
23      <node id="531">
24        <label>../stat/libEF.h</label>
25        <link refid="libEF_8h"/>
26        <childnode refid="528" relation="include">
27        </childnode>
28        <childnode refid="532" relation="include">
29        </childnode>
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31        </childnode>
32        <childnode refid="533" relation="include">
33        </childnode>
34      </node>
35      <node id="527">
36        <label>../../bdm/estim/arx.h</label>
37        <link refid="arx_8h"/>
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39        </childnode>
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41        </childnode>
42        <childnode refid="531" relation="include">
43        </childnode>
44      </node>
45      <node id="529">
46        <label>../stat/libFN.h</label>
47        <link refid="libFN_8h-source"/>
48        <childnode refid="528" relation="include">
49        </childnode>
50        <childnode refid="530" relation="include">
51        </childnode>
52      </node>
53      <node id="528">
54        <label>itpp/itbase.h</label>
55      </node>
56      <node id="525">
57        <label>work/git/mixpp/matlab/mex/linefit2.cpp</label>
58        <link refid="linefit2.cpp"/>
59        <childnode refid="526" relation="include">
60        </childnode>
61        <childnode refid="527" relation="include">
62        </childnode>
63      </node>
64      <node id="532">
65        <label>../math/libDC.h</label>
66        <link refid="libDC_8h"/>
67        <childnode refid="528" relation="include">
68        </childnode>
69      </node>
70    </incdepgraph>
71      <sectiondef kind="func">
72      <memberdef kind="function" id="linefit2_8cpp_182033299688d607730e08333ff7471f8" prot="public" static="no" const="no" explicit="no" inline="no" virt="non-virtual">
73        <type>void</type>
74        <definition>void mexFunction</definition>
75        <argsstring>(int n_output, mxArray *output[], int n_input, const mxArray *input[])</argsstring>
76        <name>mexFunction</name>
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78          <type>int</type>
79          <declname>n_output</declname>
80        </param>
81        <param>
82          <type>mxArray *</type>
83          <declname>output</declname>
84          <array>[]</array>
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87          <type>int</type>
88          <declname>n_input</declname>
89        </param>
90        <param>
91          <type>const mxArray *</type>
92          <declname>input</declname>
93          <array>[]</array>
94        </param>
95        <briefdescription>
96        </briefdescription>
97        <detaileddescription>
98        </detaileddescription>
99        <inbodydescription>
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101        <location file="/home/smidl/work/git/mixpp/matlab/mex/linefit2.cpp" line="7" bodyfile="/home/smidl/work/git/mixpp/matlab/mex/linefit2.cpp" bodystart="7" bodyend="85"/>
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104    <briefdescription>
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106    <detaileddescription>
107    </detaileddescription>
108    <programlisting>
109<codeline lineno="1"><highlight class="preprocessor">#include<sp/>&lt;itpp/itmex.h&gt;</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
110<codeline lineno="2"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
111<codeline lineno="3"><highlight class="normal"></highlight><highlight class="preprocessor">#include<sp/>&quot;../../bdm/estim/arx.h&quot;</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
112<codeline lineno="4"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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116<codeline lineno="8"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Check<sp/>the<sp/>number<sp/>of<sp/>inputs<sp/>and<sp/>output<sp/>arguments</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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118<codeline lineno="10"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>n_input!=3<sp/>)<sp/>mexErrMsgTxt<sp/>(<sp/></highlight><highlight class="stringliteral">&quot;Wrong<sp/>number<sp/>of<sp/>input<sp/>variables!&quot;</highlight><highlight class="normal"><sp/>);</highlight></codeline>
119<codeline lineno="11"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
120<codeline lineno="12"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Convert<sp/>input<sp/>variables<sp/>to<sp/>IT++<sp/>format</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
121<codeline lineno="13"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>mat<sp/>Data<sp/>=<sp/>mxArray2mat<sp/>(<sp/>input[0]<sp/>);</highlight></codeline>
122<codeline lineno="14"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>Data.rows()<sp/>!=2<sp/>)</highlight></codeline>
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124<codeline lineno="16"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>ilow<sp/>=<sp/>mxArray2int<sp/>(<sp/>input[1]<sp/>)-1;</highlight></codeline>
125<codeline lineno="17"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>ihi<sp/>=<sp/>mxArray2int<sp/>(<sp/>input[2]<sp/>)-1;<sp/></highlight><highlight class="comment">//coreection<sp/>for<sp/>different<sp/>indeces</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
126<codeline lineno="18"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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128<codeline lineno="20"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>------------------<sp/>Start<sp/>of<sp/>routine<sp/>---------------------------</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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131<codeline lineno="23"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><ref refid="classRV" kindref="compound" tooltip="Class representing variables, most often random variables.">RV</ref><sp/>thr<sp/>(<sp/></highlight><highlight class="stringliteral">&quot;1&quot;</highlight><highlight class="normal">,</highlight><highlight class="stringliteral">&quot;{<sp/>theta_r<sp/>}&quot;</highlight><highlight class="normal">,vec_1<sp/>(<sp/>npsi<sp/>),vec_1<sp/>(<sp/>0<sp/>)<sp/>);</highlight></codeline>
132<codeline lineno="24"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
133<codeline lineno="25"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>mat<sp/>V0=1e-8*eye<sp/>(<sp/>npsi<sp/>);<sp/>V0<sp/>(<sp/>0,0<sp/>)<sp/>=1e-4;</highlight></codeline>
134<codeline lineno="26"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>vec<sp/>rgr<sp/>(<sp/>npsi<sp/>);</highlight></codeline>
135<codeline lineno="27"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordtype">double</highlight><highlight class="normal"><sp/>nu0=0.1;</highlight></codeline>
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137<codeline lineno="29"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>rgr<sp/>(<sp/>2<sp/>)<sp/>=<sp/>1.0;</highlight></codeline>
138<codeline lineno="30"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
139<codeline lineno="31"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>RESULTS</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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141<codeline lineno="33"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>AR<sp/>model</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
142<codeline lineno="34"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><ref refid="classARX" kindref="compound" tooltip="Linear Autoregressive model with Gaussian noise.">ARX</ref><sp/>Ar<sp/>(<sp/>thr,V0,nu0<sp/>);</highlight></codeline>
143<codeline lineno="35"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
144<codeline lineno="36"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//Initialize</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
145<codeline lineno="37"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">for</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>i=ilow+2;<sp/>i&lt;ihi-2;<sp/>i++<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
146<codeline lineno="38"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>rgr.set_subvector<sp/>(<sp/>0,Data.get_col<sp/>(<sp/>i<sp/>)<sp/>);</highlight></codeline>
147<codeline lineno="39"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>Ar.bayes<sp/>(<sp/>rgr<sp/>);</highlight></codeline>
148<codeline lineno="40"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
149<codeline lineno="41"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>FLATTEN</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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151<codeline lineno="43"><highlight class="comment"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>V0<sp/>*=1.0/nu0/10000.;<sp/>//<sp/>same<sp/>flattening<sp/>factor<sp/>as<sp/>for<sp/>nu0</highlight></codeline>
152<codeline lineno="44"><highlight class="comment"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>nu0=1./10000.;*/</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
153<codeline lineno="45"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>Ar.set_parameters<sp/>(<sp/>V0,nu0<sp/>);</highlight></codeline>
154<codeline lineno="46"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
155<codeline lineno="47"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">for</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>i=ilow;<sp/>i&lt;=ihi;<sp/>i++<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
156<codeline lineno="48"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>Ar.set_parameters<sp/>(<sp/>V0,nu0<sp/>);</highlight></codeline>
157<codeline lineno="49"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">for</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>t=i;<sp/>t&lt;=ihi;<sp/>t++<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
158<codeline lineno="50"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>rgr.set_subvector<sp/>(<sp/>0,Data.get_col<sp/>(<sp/>t<sp/>)<sp/>);</highlight></codeline>
159<codeline lineno="51"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>Ar.bayes<sp/>(<sp/>rgr<sp/>);</highlight></codeline>
160<codeline lineno="52"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>Tlls<sp/>(<sp/>i,t<sp/>)<sp/>=Ar._tll();</highlight></codeline>
161<codeline lineno="53"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
162<codeline lineno="54"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
163<codeline lineno="55"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
164<codeline lineno="56"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>max_index<sp/>(<sp/>Tlls,ilow,ihi<sp/>);</highlight></codeline>
165<codeline lineno="57"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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167<codeline lineno="59"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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169<codeline lineno="61"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>ivec2mxArray<sp/>(<sp/>vec_2<sp/>(<sp/>ilow+1,ihi+1<sp/>)<sp/>,<sp/>output[0]<sp/>);</highlight></codeline>
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171<codeline lineno="63"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>n_output&gt;1<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
172<codeline lineno="64"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Create<sp/>output<sp/>vectors</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
173<codeline lineno="65"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>output[1]<sp/>=<sp/>mxCreateDoubleMatrix<sp/>(<sp/>Tlls.rows(),Tlls.cols(),<sp/>mxREAL<sp/>);</highlight></codeline>
174<codeline lineno="66"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Convert<sp/>the<sp/>IT++<sp/>format<sp/>to<sp/>Matlab<sp/>format<sp/>for<sp/>output</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
175<codeline lineno="67"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>mat2mxArray<sp/>(<sp/>Tlls,<sp/>output[1]<sp/>);</highlight></codeline>
176<codeline lineno="68"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
177<codeline lineno="69"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
178<codeline lineno="70"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>n_output&gt;2<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
179<codeline lineno="71"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>Ar.set_parameters<sp/>(<sp/>V0,nu0<sp/>);</highlight></codeline>
180<codeline lineno="72"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Redo<sp/>Ar<sp/>for<sp/>given<sp/>points</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
181<codeline lineno="73"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">for</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>i=ilow;<sp/>i&lt;=ihi;<sp/>i++<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
182<codeline lineno="74"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>rgr.set_subvector<sp/>(<sp/>0,Data.get_col<sp/>(<sp/>i<sp/>)<sp/>);</highlight></codeline>
183<codeline lineno="75"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>Ar.bayes<sp/>(<sp/>rgr<sp/>);</highlight></codeline>
184<codeline lineno="76"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
185<codeline lineno="77"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
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