root/doc/xml/matlab_2mex_2arx_8cpp.xml @ 267

Revision 187, 13.4 kB (checked in by smidl, 16 years ago)

doc

Line 
1<?xml version='1.0' encoding='UTF-8' standalone='no'?>
2<doxygen xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:noNamespaceSchemaLocation="compound.xsd" version="1.5.6">
3  <compounddef id="matlab_2mex_2arx_8cpp" kind="file">
4    <compoundname>arx.cpp</compoundname>
5    <includes local="no">itpp/itcomm.h</includes>
6    <includes local="no">itpp/itmex.h</includes>
7    <includes refid="arx_8h" local="yes">../../bdm/estim/arx.h</includes>
8    <incdepgraph>
9      <node id="199">
10        <label>libBM.h</label>
11        <link refid="libBM_8h"/>
12        <childnode refid="197" relation="include">
13        </childnode>
14      </node>
15      <node id="195">
16        <label>itpp/itmex.h</label>
17      </node>
18      <node id="202">
19        <label>../itpp_ext.h</label>
20        <link refid="itpp__ext_8h-source"/>
21        <childnode refid="197" relation="include">
22        </childnode>
23      </node>
24      <node id="193">
25        <label>work/git/mixpp/matlab/mex/arx.cpp</label>
26        <link refid="matlab/mex/arx.cpp"/>
27        <childnode refid="194" relation="include">
28        </childnode>
29        <childnode refid="195" relation="include">
30        </childnode>
31        <childnode refid="196" relation="include">
32        </childnode>
33      </node>
34      <node id="200">
35        <label>../stat/libEF.h</label>
36        <link refid="libEF_8h"/>
37        <childnode refid="197" relation="include">
38        </childnode>
39        <childnode refid="201" relation="include">
40        </childnode>
41        <childnode refid="199" relation="include">
42        </childnode>
43        <childnode refid="202" relation="include">
44        </childnode>
45      </node>
46      <node id="196">
47        <label>../../bdm/estim/arx.h</label>
48        <link refid="arx_8h"/>
49        <childnode refid="197" relation="include">
50        </childnode>
51        <childnode refid="198" relation="include">
52        </childnode>
53        <childnode refid="200" relation="include">
54        </childnode>
55      </node>
56      <node id="198">
57        <label>../stat/libFN.h</label>
58        <link refid="libFN_8h-source"/>
59        <childnode refid="197" relation="include">
60        </childnode>
61        <childnode refid="199" relation="include">
62        </childnode>
63      </node>
64      <node id="197">
65        <label>itpp/itbase.h</label>
66      </node>
67      <node id="194">
68        <label>itpp/itcomm.h</label>
69      </node>
70      <node id="201">
71        <label>../math/libDC.h</label>
72        <link refid="libDC_8h"/>
73        <childnode refid="197" relation="include">
74        </childnode>
75      </node>
76    </incdepgraph>
77      <sectiondef kind="func">
78      <memberdef kind="function" id="matlab_2mex_2arx_8cpp_182033299688d607730e08333ff7471f8" prot="public" static="no" const="no" explicit="no" inline="no" virt="non-virtual">
79        <type>void</type>
80        <definition>void mexFunction</definition>
81        <argsstring>(int n_output, mxArray *output[], int n_input, const mxArray *input[])</argsstring>
82        <name>mexFunction</name>
83        <param>
84          <type>int</type>
85          <declname>n_output</declname>
86        </param>
87        <param>
88          <type>mxArray *</type>
89          <declname>output</declname>
90          <array>[]</array>
91        </param>
92        <param>
93          <type>int</type>
94          <declname>n_input</declname>
95        </param>
96        <param>
97          <type>const mxArray *</type>
98          <declname>input</declname>
99          <array>[]</array>
100        </param>
101        <briefdescription>
102        </briefdescription>
103        <detaileddescription>
104        </detaileddescription>
105        <inbodydescription>
106        </inbodydescription>
107        <location file="/home/smidl/work/git/mixpp/matlab/mex/arx.cpp" line="8" bodyfile="/home/smidl/work/git/mixpp/matlab/mex/arx.cpp" bodystart="8" bodyend="47"/>
108      </memberdef>
109      </sectiondef>
110    <briefdescription>
111    </briefdescription>
112    <detaileddescription>
113    </detaileddescription>
114    <programlisting>
115<codeline lineno="1"><highlight class="preprocessor">#include<sp/>&lt;itpp/itcomm.h&gt;</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
116<codeline lineno="2"><highlight class="normal"></highlight><highlight class="preprocessor">#include<sp/>&lt;itpp/itmex.h&gt;</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
117<codeline lineno="3"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
118<codeline lineno="4"><highlight class="normal"></highlight><highlight class="preprocessor">#include<sp/>&quot;../../bdm/estim/arx.h&quot;</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
119<codeline lineno="5"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
120<codeline lineno="6"><highlight class="normal"></highlight><highlight class="keyword">using<sp/>namespace<sp/></highlight><highlight class="normal">itpp;</highlight></codeline>
121<codeline lineno="7"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
122<codeline lineno="8"><highlight class="normal"></highlight><highlight class="keywordtype">void</highlight><highlight class="normal"><sp/>mexFunction<sp/>(<sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>n_output,<sp/>mxArray<sp/>*output[],<sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>n_input,<sp/></highlight><highlight class="keyword">const</highlight><highlight class="normal"><sp/>mxArray<sp/>*input[]<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
123<codeline lineno="9"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Check<sp/>the<sp/>number<sp/>of<sp/>inputs<sp/>and<sp/>output<sp/>arguments</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
124<codeline lineno="10"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>n_output&lt;1<sp/>)<sp/>mexErrMsgTxt<sp/>(<sp/></highlight><highlight class="stringliteral">&quot;Wrong<sp/>number<sp/>of<sp/>output<sp/>variables!&quot;</highlight><highlight class="normal"><sp/>);</highlight></codeline>
125<codeline lineno="11"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>n_input!=1<sp/>)<sp/>mexErrMsgTxt<sp/>(<sp/></highlight><highlight class="stringliteral">&quot;Wrong<sp/>number<sp/>of<sp/>input<sp/>variables!&quot;</highlight><highlight class="normal"><sp/>);</highlight></codeline>
126<codeline lineno="12"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
127<codeline lineno="13"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Convert<sp/>input<sp/>variables<sp/>to<sp/>IT++<sp/>format</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
128<codeline lineno="14"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>mat<sp/>Data<sp/>=<sp/>mxArray2mat<sp/>(<sp/>input[0]<sp/>);</highlight></codeline>
129<codeline lineno="15"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
130<codeline lineno="16"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>------------------<sp/>Start<sp/>of<sp/>routine<sp/>---------------------------</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
131<codeline lineno="17"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>ndat=Data.cols();</highlight></codeline>
132<codeline lineno="18"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>npsi=Data.rows();</highlight></codeline>
133<codeline lineno="19"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><ref refid="classRV" kindref="compound" tooltip="Class representing variables, most often random variables.">RV</ref><sp/>thr<sp/>(<sp/></highlight><highlight class="stringliteral">&quot;1&quot;</highlight><highlight class="normal">,</highlight><highlight class="stringliteral">&quot;{<sp/>theta_r<sp/>}&quot;</highlight><highlight class="normal">,vec_1<sp/>(<sp/>npsi<sp/>),vec_1<sp/>(<sp/>0<sp/>)<sp/>);</highlight></codeline>
134<codeline lineno="20"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
135<codeline lineno="21"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>mat<sp/>V0=1e-8*eye<sp/>(<sp/>npsi<sp/>);<sp/>V0<sp/>(<sp/>0,0<sp/>)<sp/>*=100.0;</highlight></codeline>
136<codeline lineno="22"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordtype">double</highlight><highlight class="normal"><sp/>nu0=npsi;</highlight></codeline>
137<codeline lineno="23"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><ref refid="classARX" kindref="compound" tooltip="Linear Autoregressive model with Gaussian noise.">ARX</ref><sp/>Ar<sp/>(<sp/>thr,V0,nu0<sp/>);</highlight></codeline>
138<codeline lineno="24"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>estimate</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
139<codeline lineno="25"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">for</highlight><highlight class="normal"><sp/>(</highlight><highlight class="keywordtype">int</highlight><highlight class="normal"><sp/>i=0;i&lt;ndat;i++<sp/>)<sp/>{Ar.bayes<sp/>(<sp/>Data.get_col<sp/>(<sp/>i<sp/>)<sp/>);<sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
140<codeline lineno="26"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
141<codeline lineno="27"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>vec<sp/>th<sp/>=<sp/>Ar._epdf().mean();</highlight></codeline>
142<codeline lineno="28"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
143<codeline lineno="29"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>------------------<sp/>End<sp/>of<sp/>routine<sp/>-----------------------------</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
144<codeline lineno="30"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
145<codeline lineno="31"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Create<sp/>output<sp/>vectors</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
146<codeline lineno="32"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>output[0]<sp/>=<sp/>mxCreateDoubleMatrix<sp/>(<sp/>1,th.length(),<sp/>mxREAL<sp/>);</highlight></codeline>
147<codeline lineno="33"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="comment">//<sp/>Convert<sp/>the<sp/>IT++<sp/>format<sp/>to<sp/>Matlab<sp/>format<sp/>for<sp/>output</highlight><highlight class="normal"></highlight></codeline>
148<codeline lineno="34"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>vec2mxArray<sp/>(<sp/>th,<sp/>output[0]<sp/>);</highlight></codeline>
149<codeline lineno="35"><highlight class="normal"></highlight></codeline>
150<codeline lineno="36"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>n_output&gt;1<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
151<codeline lineno="37"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordtype">double</highlight><highlight class="normal"><sp/>ll=Ar._tll();</highlight></codeline>
152<codeline lineno="38"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>output[1]<sp/>=<sp/>mxCreateDoubleMatrix<sp/>(<sp/>1,1,<sp/>mxREAL<sp/>);</highlight></codeline>
153<codeline lineno="39"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>double2mxArray<sp/>(<sp/>ll,<sp/>output[1]<sp/>);</highlight></codeline>
154<codeline lineno="40"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
155<codeline lineno="41"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight></codeline>
156<codeline lineno="42"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/></highlight><highlight class="keywordflow">if</highlight><highlight class="normal"><sp/>(<sp/>n_output&gt;2<sp/>)<sp/>{</highlight></codeline>
157<codeline lineno="43"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>ivec<sp/><ref refid="classstr" kindref="compound" tooltip="Structure of RV (used internally).">str</ref><sp/>=<sp/>Ar.structure_est<sp/>(<sp/><ref refid="classegiw" kindref="compound" tooltip="Gauss-inverse-Wishart density stored in LD form.">egiw</ref><sp/>(<sp/>thr,V0,nu0<sp/>)<sp/>);</highlight></codeline>
158<codeline lineno="44"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>output[2]<sp/>=<sp/>mxCreateDoubleMatrix<sp/>(<sp/>1,str.length(),<sp/>mxREAL<sp/>);</highlight></codeline>
159<codeline lineno="45"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>ivec2mxArray<sp/>(<sp/>str,<sp/>output[2]<sp/>);</highlight></codeline>
160<codeline lineno="46"><highlight class="normal"><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/><sp/>}</highlight></codeline>
161<codeline lineno="47"><highlight class="normal">}</highlight></codeline>
162    </programlisting>
163    <location file="/home/smidl/work/git/mixpp/matlab/mex/arx.cpp"/>
164  </compounddef>
165</doxygen>
Note: See TracBrowser for help on using the browser.