root/library/bdm/mex/mex_datasource.h @ 676

Revision 676, 3.6 kB (checked in by smidl, 15 years ago)

logger refactoring

Line 
1#ifndef MXDS_H
2#define MXDS_H
3
4
5#include "../bdm/bdmerror.h"
6#include "../bdm/base/datasources.h"
7#include "mex_parser.h"
8
9namespace bdm {
10/*!
11* \brief Memory storage of off-line data column-wise
12
13The data are stored in an internal matrix \c Data . Each column of Data corresponds to one discrete time observation \f$t\f$. Access to this matrix is via indices \c rowid and \c delays.
14
15The data can be loaded from a file.
16*/
17class mxArrayDS : public MemDS {
18        public:
19        //!Default constructor
20        mxArrayDS ():MemDS() {};
21
22        /*! \brief Create memory data source from mxArray
23
24        \code
25        system={
26                type="mexDS";
27                varname="";                // name of workspace variable
28                row_rv = {class='RV',...}  // definition of
29                };
30        \endcode
31
32        MemDS with the above fields will be created;
33
34        */
35        void from_setting ( const Setting &set ) {
36                Data = mxArray2mat ( mexGetVariable ( "base", set["varname"] ) );
37/*              UI::get ( rowid, set, "rids" , UI::compulsory );
38                bdm_assert_debug ( max ( rowid ) <= Data.rows(), "MemDS rowid is too high for given Dat." );
39
40                UI::get ( delays, set, "tds", UI::compulsory );
41                time = max ( delays );
42                bdm_assert_debug ( time < Data.cols(), "MemDS delays are too high." );
43*/
44                //set MemDS
45                rowid = linspace(0,Data.rows()-1);
46                dtsize=rowid.length();
47                ytsize=rowid.length();
48                utsize=0;
49               
50                shared_ptr<RV> r = UI::build<RV> ( set, "rv", UI::optional );
51                RV ru = RV();
52                if (r){
53                        set_drv ( *r, ru );
54                } else {
55                        RV def((const char*)set["varname"],Data.rows());
56                        set_drv(def, ru);
57                }
58        }
59
60
61        // TODO dodelat void to_setting( Setting &set ) const;
62};
63
64UIREGISTER ( mxArrayDS );
65SHAREDPTR ( mxArrayDS );
66
67/*!
68* \brief Matlab wrapper for DS mapping functions step() to a matlab function
69
70The identifier of matlab function is stored in attribute \c name.
71This identifier defines:
72\li function to call to do a step(): name_step.m
73\li workspace variable to write input to: name_input
74*/
75class mexDS : public DS {
76        protected:
77                //! identifier of matlab function
78                string step_name;
79                //! identifier of matlab input variabel
80                string input_name;
81                //! cache of results from name_step
82                vec dt;
83                //! cache of inputs
84                vec ut;
85        public:
86        //!Default constructor
87        mexDS ():DS() {};
88
89        /*! \brief Create memory data source from mxArray
90
91        \code
92        system={
93                type="mexDS";
94                step_name="";              // name of function to call
95                input_name="";             // name of workspace variable where inputs are written
96                rv_out = {class='RV',...}  // identification of outputs
97                rv_in = {class='RV',...}   // identification of inputs
98                };
99        \endcode
100
101        MemDS with the above fields will be created;
102
103        */
104        void from_setting ( const Setting &set ) {
105                UI::get(step_name, set, "step_name", UI::compulsory);
106                UI::get(input_name, set, "input_name", UI::compulsory);
107               
108                shared_ptr<RV> ry = UI::build<RV> ( set, "rv_out", UI::compulsory );
109                shared_ptr<RV> ru = UI::build<RV> ( set, "rv_in", UI::compulsory);
110
111                dtsize=ry->_dsize();
112                utsize=ru->_dsize();
113
114                set_drv(*ry, *ru);
115        }
116       
117        void step() {
118                mxArray* tmp;
119                mxArray* tmp2;
120                // write inputs to variable input_name
121                mxArray* mxinp= mexGetVariable ( "global", input_name.c_str()) ;
122                vec2mxArray(ut, mxinp);
123                // call function step_name
124                mexCallMATLAB(1, &tmp, 0, (mxArray **) &tmp2, step_name.c_str());
125                // save its results
126                dt=mxArray2vec(tmp);
127        }
128        void write(const vec &ut0){ ut=ut0;}
129        void getdata(vec &dt_out) const {dt_out = dt;   }
130
131
132        // TODO dodelat void to_setting( Setting &set ) const;
133};
134
135UIREGISTER ( mexDS );
136SHAREDPTR ( mexDS );
137
138}
139#endif //MXDS_H
Note: See TracBrowser for help on using the browser.