root/library/tests/epdf_harness.cpp @ 722

Revision 722, 8.0 kB (checked in by mido, 15 years ago)

astyler run over all test sources
general_suite added
cleanup of \test directory finished

  • Property svn:eol-style set to native
RevLine 
[436]1#include "epdf_harness.h"
[456]2#include "base/bdmbase.h"
3#include "base/user_info.h"
[436]4#include "stat/exp_family.h"
5#include "mat_checks.h"
6#include "test_util.h"
7#include "UnitTest++.h"
[462]8#include <memory>
[436]9
10namespace bdm {
11
[477]12void epdf_harness::test_config ( const char *config_file_name ) {
13        RV::clear_all();
[456]14
[477]15        UIFile in ( config_file_name );
[527]16        Array<shared_ptr<epdf_harness> > input;
[480]17        UI::get ( input, in, "data", UI::compulsory );
[477]18        int sz = input.size();
19        CHECK ( sz > 0 );
20        for ( int i = 0; i < sz; ++i ) {
21                input ( i )->test ( config_file_name, i );
22        }
[456]23}
24
[477]25void epdf_harness::from_setting ( const Setting &set ) {
26        hepdf = UI::build<epdf> ( set, "epdf", UI::compulsory );
27        UI::get ( mean, set, "mean", UI::compulsory );
28        UI::get ( variance, set, "variance", UI::compulsory );
[436]29
[722]30        UI::get ( support, set, "support", UI::optional );
31        UI::get ( nbins, set, "nbins", UI::optional );
32        UI::get ( nsamples, set, "nsamples", UI::optional );
33        UI::get ( R, set, "R", UI::optional );
[441]34
[722]35        mrv = UI::build<RV> ( set, "marginal_rv", UI::optional );
[442]36
[480]37        UI::get ( tolerance, set, "tolerance", UI::optional );
[436]38}
39
[477]40void epdf_harness::test ( const char *config_name, int idx ) {
41        CurrentContext cc ( config_name, idx );
[436]42
[477]43        CHECK_CLOSE_EX ( mean, hepdf->mean(), tolerance );
44        CHECK_CLOSE_EX ( variance, hepdf->variance(), tolerance );
[456]45
[477]46        if ( support.rows() == 2 ) {
47                int old_size = nbins.size();
48                if ( old_size < 2 ) {
[482]49                        ivec new_nbins ( "100 100" );
[477]50                        for ( int i = 0; i < old_size; ++i ) {
51                                new_nbins ( i ) = nbins ( i );
52                        }
[442]53
[477]54                        nbins = new_nbins;
55                }
56
[481]57                check_support_mean();
58                check_support_integral();
[442]59        }
60
[477]61        if ( R.rows() > 0 ) {
[481]62                check_sample_mean();
63                check_covariance();
[477]64        }
[465]65
[529]66        if ( mrv ) {
[477]67                RV crv = hepdf->_rv().subt ( *mrv );
[529]68                epdf_ptr m = hepdf->marginal ( *mrv );
[693]69                pdf_ptr c = hepdf->condition ( crv );
[462]70
[693]71                pdf_array aa ( 2 );
[507]72                aa ( 0 ) = c;
[675]73                aa ( 1 ) = m;
[477]74                mprod mEp ( aa );
[462]75
[722]76                check_cond_mean ( mEp );
[477]77                if ( R.rows() > 0 ) {
[722]78                        check_cond_covariance ( mEp );
[477]79                }
[466]80
[477]81                // test of pdflog at zero
82                vec zero ( 0 );
[722]83                vec zeron = zeros ( hepdf->dimension() );
[462]84
[502]85                double lpz = hepdf->evallog ( zeron );
[722]86                double lpzc = mEp.evallogcond ( zeron, zero );
[598]87                CHECK_CLOSE_EX ( lpz, lpzc, tolerance );
[502]88
[722]89                vec lpzv ( 1 );
90                lpzv ( 0 ) = lpz;
[502]91
92                mat zero1n ( hepdf->dimension(), 1 );
93                for ( int i = 0; i < zero1n.rows(); ++i ) {
94                        zero1n ( i, 0 ) = 0;
95                }
96
[713]97                vec lpzv_act = hepdf->evallog_mat ( zero1n );
[502]98                CHECK_CLOSE_EX ( lpzv, lpzv_act, tolerance );
99
[722]100                Array<vec> zeroa ( 3 );
101                lpzv = vec ( zeroa.size() );
[502]102                for ( int i = 0; i < zeroa.size(); ++i ) {
[722]103                        zeroa ( i ) = zeron;
104                        lpzv ( i ) = lpz;
[502]105                }
106
[713]107                lpzv_act = hepdf->evallog_mat ( zeroa );
[502]108                CHECK_CLOSE_EX ( lpzv, lpzv_act, tolerance );
[462]109        }
[436]110}
111
[481]112void epdf_harness::check_support_mean() {
113        vec xb = support.get_row ( 0 );
114        vec yb = support.get_row ( 1 );
115
116        int tc = 0;
[722]117        Array<vec> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]118        do {
119                vec emu = num_mean2 ( hepdf.get(), xb, yb, nbins ( 0 ), nbins ( 1 ) );
[722]120                actual ( tc ) = emu;
[481]121                ++tc;
122        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]123                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
[481]124        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]125                ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]126                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]127                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]128
[722]129                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]130
131                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]132        }
[436]133}
[481]134
135void epdf_harness::check_support_integral() {
136        vec xb = support.get_row ( 0 );
137        vec yb = support.get_row ( 1 );
138
139        int tc = 0;
[722]140        Array<double> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]141        do {
142                double nc = normcoef ( hepdf.get(), xb, yb, nbins ( 0 ), nbins ( 1 ) );
[722]143                actual ( tc ) = nc;
[481]144                ++tc;
145        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]146                  !UnitTest::AreClose ( 1.0, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
[481]147        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]148                ( !UnitTest::AreClose ( 1.0, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]149                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]150                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]151
[722]152                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]153
154                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]155        }
[481]156}
157
158void epdf_harness::check_sample_mean() {
[484]159        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
[481]160
161        int tc = 0;
[722]162        Array<vec> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]163        do {
[713]164                mat smp = hepdf->sample_mat ( nsamples );
[481]165                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
[722]166                actual ( tc ) = emu;
[481]167                ++tc;
168        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]169                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( tc - 1 ), delta ) );
[481]170        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]171                ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
[481]172                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]173                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
[481]174
[722]175                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]176
177                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]178        }
[481]179}
180
181void epdf_harness::check_covariance() {
182        int tc = 0;
[722]183        Array<mat> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]184        do {
[713]185                mat smp = hepdf->sample_mat ( nsamples );
[481]186                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
187                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
[722]188                actual ( tc ) = er;
[481]189                ++tc;
190        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]191                  !UnitTest::AreClose ( R, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
192
[481]193        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]194                ( !UnitTest::AreClose ( R, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]195                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]196                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << R << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]197
[722]198                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]199
200                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]201        }
[481]202}
203
[722]204void epdf_harness::check_cond_mean ( mprod &mep ) {
[484]205        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
[481]206
207        int tc = 0;
[722]208        Array<vec> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]209        do {
[713]210                mat smp = mep.samplecond_mat ( vec ( 0 ), nsamples );
[481]211                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
[722]212                actual ( tc ) = emu;
[481]213                ++tc;
214        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]215                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( tc - 1 ), delta ) );
[481]216        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]217                ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
[481]218                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]219                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
[481]220
[722]221                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]222
223                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]224        }
[481]225}
226
[722]227void epdf_harness::check_cond_covariance ( mprod &mep ) {
[481]228        int tc = 0;
[722]229        Array<mat> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]230        do {
[713]231                mat smp = mep.samplecond_mat ( vec ( 0 ), nsamples );
[481]232                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
233                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
[722]234                actual ( tc ) = er;
[481]235                ++tc;
236        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]237                  !UnitTest::AreClose ( R, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
[481]238        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]239                ( !UnitTest::AreClose ( R, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]240                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]241                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]242
[722]243                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]244
245                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]246        }
[481]247}
248
249}
Note: See TracBrowser for help on using the browser.