root/library/tests/epdf_harness.cpp @ 725

Revision 725, 6.7 kB (checked in by smidl, 15 years ago)

Sampling from egiw

  • Property svn:eol-style set to native
RevLine 
[436]1#include "epdf_harness.h"
[456]2#include "base/bdmbase.h"
3#include "base/user_info.h"
[436]4#include "stat/exp_family.h"
5#include "mat_checks.h"
6#include "test_util.h"
7#include "UnitTest++.h"
[462]8#include <memory>
[436]9
10namespace bdm {
11
[477]12void epdf_harness::test_config ( const char *config_file_name ) {
13        RV::clear_all();
[456]14
[477]15        UIFile in ( config_file_name );
[527]16        Array<shared_ptr<epdf_harness> > input;
[480]17        UI::get ( input, in, "data", UI::compulsory );
[477]18        int sz = input.size();
19        CHECK ( sz > 0 );
20        for ( int i = 0; i < sz; ++i ) {
21                input ( i )->test ( config_file_name, i );
22        }
[456]23}
24
[477]25void epdf_harness::from_setting ( const Setting &set ) {
26        hepdf = UI::build<epdf> ( set, "epdf", UI::compulsory );
27        UI::get ( mean, set, "mean", UI::compulsory );
28        UI::get ( variance, set, "variance", UI::compulsory );
[436]29
[722]30        UI::get ( support, set, "support", UI::optional );
31        UI::get ( nbins, set, "nbins", UI::optional );
32        UI::get ( nsamples, set, "nsamples", UI::optional );
33        UI::get ( R, set, "R", UI::optional );
[441]34
[722]35        mrv = UI::build<RV> ( set, "marginal_rv", UI::optional );
[442]36
[480]37        UI::get ( tolerance, set, "tolerance", UI::optional );
[436]38}
39
[477]40void epdf_harness::test ( const char *config_name, int idx ) {
41        CurrentContext cc ( config_name, idx );
[436]42
[477]43        CHECK_CLOSE_EX ( mean, hepdf->mean(), tolerance );
44        CHECK_CLOSE_EX ( variance, hepdf->variance(), tolerance );
[456]45
[477]46        if ( support.rows() == 2 ) {
47                int old_size = nbins.size();
48                if ( old_size < 2 ) {
[482]49                        ivec new_nbins ( "100 100" );
[477]50                        for ( int i = 0; i < old_size; ++i ) {
51                                new_nbins ( i ) = nbins ( i );
52                        }
[442]53
[477]54                        nbins = new_nbins;
55                }
56
[481]57                check_support_mean();
58                check_support_integral();
[442]59        }
60
[725]61        if ( variance.length() > 0 ) {
[481]62                check_sample_mean();
[725]63        }
64        if (R.rows()>0){
[481]65                check_covariance();
[477]66        }
[465]67
[529]68        if ( mrv ) {
[477]69                RV crv = hepdf->_rv().subt ( *mrv );
[529]70                epdf_ptr m = hepdf->marginal ( *mrv );
[693]71                pdf_ptr c = hepdf->condition ( crv );
[462]72
[693]73                pdf_array aa ( 2 );
[507]74                aa ( 0 ) = c;
[675]75                aa ( 1 ) = m;
[477]76                mprod mEp ( aa );
[462]77
[722]78                check_cond_mean ( mEp );
[477]79                if ( R.rows() > 0 ) {
[722]80                        check_cond_covariance ( mEp );
[477]81                }
[466]82
[477]83                // test of pdflog at zero
84                vec zero ( 0 );
[722]85                vec zeron = zeros ( hepdf->dimension() );
[462]86
[502]87                double lpz = hepdf->evallog ( zeron );
[722]88                double lpzc = mEp.evallogcond ( zeron, zero );
[598]89                CHECK_CLOSE_EX ( lpz, lpzc, tolerance );
[502]90
[722]91                vec lpzv ( 1 );
92                lpzv ( 0 ) = lpz;
[502]93
94                mat zero1n ( hepdf->dimension(), 1 );
95                for ( int i = 0; i < zero1n.rows(); ++i ) {
96                        zero1n ( i, 0 ) = 0;
97                }
98
[713]99                vec lpzv_act = hepdf->evallog_mat ( zero1n );
[502]100                CHECK_CLOSE_EX ( lpzv, lpzv_act, tolerance );
101
[722]102                Array<vec> zeroa ( 3 );
103                lpzv = vec ( zeroa.size() );
[502]104                for ( int i = 0; i < zeroa.size(); ++i ) {
[722]105                        zeroa ( i ) = zeron;
106                        lpzv ( i ) = lpz;
[502]107                }
108
[713]109                lpzv_act = hepdf->evallog_mat ( zeroa );
[502]110                CHECK_CLOSE_EX ( lpzv, lpzv_act, tolerance );
[462]111        }
[436]112}
113
[481]114void epdf_harness::check_support_mean() {
115        vec xb = support.get_row ( 0 );
116        vec yb = support.get_row ( 1 );
117
[725]118        vec actual;
119        actual = num_mean2 ( hepdf.get(), xb, yb, nbins ( 0 ), nbins ( 1 ) );
[481]120
[725]121        CHECK_CLOSE(mean, actual, tolerance);
[436]122}
[481]123
124void epdf_harness::check_support_integral() {
125        vec xb = support.get_row ( 0 );
126        vec yb = support.get_row ( 1 );
127
[725]128        double nc = normcoef ( hepdf.get(), xb, yb, nbins ( 0 ), nbins ( 1 ) );
129        CHECK_CLOSE(1.0,nc,0.01);
[481]130}
131
132void epdf_harness::check_sample_mean() {
[484]133        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
[481]134
135        int tc = 0;
[722]136        Array<vec> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]137        do {
[713]138                mat smp = hepdf->sample_mat ( nsamples );
[481]139                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
[722]140                actual ( tc ) = emu;
[481]141                ++tc;
142        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]143                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( tc - 1 ), delta ) );
[725]144                         
[481]145        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]146                ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
[481]147                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]148                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
[481]149
[722]150                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]151
152                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]153        }
[481]154}
155
156void epdf_harness::check_covariance() {
157        int tc = 0;
[722]158        Array<mat> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]159        do {
[713]160                mat smp = hepdf->sample_mat ( nsamples );
[481]161                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
162                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
[722]163                actual ( tc ) = er;
[481]164                ++tc;
165        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]166                  !UnitTest::AreClose ( R, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
167
[481]168        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]169                ( !UnitTest::AreClose ( R, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]170                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]171                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << R << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]172
[722]173                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]174
175                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]176        }
[481]177}
178
[722]179void epdf_harness::check_cond_mean ( mprod &mep ) {
[484]180        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
[481]181
182        int tc = 0;
[722]183        Array<vec> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]184        do {
[713]185                mat smp = mep.samplecond_mat ( vec ( 0 ), nsamples );
[481]186                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
[722]187                actual ( tc ) = emu;
[481]188                ++tc;
189        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]190                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( tc - 1 ), delta ) );
[481]191        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]192                ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
[481]193                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]194                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
[481]195
[722]196                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]197
198                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]199        }
[481]200}
201
[722]202void epdf_harness::check_cond_covariance ( mprod &mep ) {
[481]203        int tc = 0;
[722]204        Array<mat> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]205        do {
[713]206                mat smp = mep.samplecond_mat ( vec ( 0 ), nsamples );
[481]207                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
208                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
[722]209                actual ( tc ) = er;
[481]210                ++tc;
211        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]212                  !UnitTest::AreClose ( R, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
[481]213        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]214                ( !UnitTest::AreClose ( R, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]215                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]216                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]217
[722]218                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]219
220                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]221        }
[481]222}
223
224}
Note: See TracBrowser for help on using the browser.