root/library/tests/epdf_harness.cpp @ 737

Revision 737, 6.7 kB (checked in by mido, 15 years ago)

ASTYLER RUN OVER THE WHOLE LIBRARY, JUPEE

  • Property svn:eol-style set to native
RevLine 
[436]1#include "epdf_harness.h"
[456]2#include "base/bdmbase.h"
3#include "base/user_info.h"
[436]4#include "stat/exp_family.h"
5#include "mat_checks.h"
6#include "test_util.h"
7#include "UnitTest++.h"
[462]8#include <memory>
[436]9
10namespace bdm {
11
[477]12void epdf_harness::test_config ( const char *config_file_name ) {
13        RV::clear_all();
[456]14
[477]15        UIFile in ( config_file_name );
[527]16        Array<shared_ptr<epdf_harness> > input;
[480]17        UI::get ( input, in, "data", UI::compulsory );
[477]18        int sz = input.size();
19        CHECK ( sz > 0 );
20        for ( int i = 0; i < sz; ++i ) {
21                input ( i )->test ( config_file_name, i );
22        }
[456]23}
24
[477]25void epdf_harness::from_setting ( const Setting &set ) {
26        hepdf = UI::build<epdf> ( set, "epdf", UI::compulsory );
27        UI::get ( mean, set, "mean", UI::compulsory );
28        UI::get ( variance, set, "variance", UI::compulsory );
[436]29
[730]30        support = UI::build<rectangular_support> ( set, "support", UI::optional );
[722]31        UI::get ( nsamples, set, "nsamples", UI::optional );
32        UI::get ( R, set, "R", UI::optional );
[441]33
[722]34        mrv = UI::build<RV> ( set, "marginal_rv", UI::optional );
[442]35
[480]36        UI::get ( tolerance, set, "tolerance", UI::optional );
[436]37}
38
[477]39void epdf_harness::test ( const char *config_name, int idx ) {
40        CurrentContext cc ( config_name, idx );
[436]41
[477]42        CHECK_CLOSE_EX ( mean, hepdf->mean(), tolerance );
43        CHECK_CLOSE_EX ( variance, hepdf->variance(), tolerance );
[456]44
[730]45        if ( support ) { // support is given
46                grid_fnc ep_disc;
[737]47                ep_disc.set_support ( *support );
48                ep_disc.set_values ( *hepdf );
[730]49                // ep_disc is discretized at support points
[442]50
[737]51                double point_volume = prod ( support->_steps() );
52                CHECK_CLOSE ( 1.0, sum ( ep_disc._values() ) *point_volume, 0.01 );
[477]53
[737]54                vec pdf = ep_disc._values();
55                pdf /= sum ( pdf ); // normalize
[730]56
[737]57                vec mea = pdf ( 0 ) * support->first_vec();
58                mat Remp = pdf ( 0 ) * outer_product ( support->act_vec(), support->act_vec() );
59
[730]60                // run through all points
[737]61                for ( int i = 1; i < support->points(); i++ ) {
62                        mea += pdf ( i ) * support->next_vec();
63                        Remp += pdf ( i ) * outer_product ( support->act_vec(), support->act_vec() );
[730]64                }
[737]65                CHECK_CLOSE ( mean, mea, tolerance );
66                CHECK_CLOSE ( R, Remp - outer_product ( mea, mea ), tolerance );
[442]67        }
68
[725]69        if ( variance.length() > 0 ) {
[481]70                check_sample_mean();
[725]71        }
[737]72        if ( R.rows() > 0 ) {
[481]73                check_covariance();
[477]74        }
[465]75
[529]76        if ( mrv ) {
[477]77                RV crv = hepdf->_rv().subt ( *mrv );
[529]78                epdf_ptr m = hepdf->marginal ( *mrv );
[693]79                pdf_ptr c = hepdf->condition ( crv );
[462]80
[693]81                pdf_array aa ( 2 );
[507]82                aa ( 0 ) = c;
[675]83                aa ( 1 ) = m;
[477]84                mprod mEp ( aa );
[462]85
[722]86                check_cond_mean ( mEp );
[477]87                if ( R.rows() > 0 ) {
[722]88                        check_cond_covariance ( mEp );
[477]89                }
[466]90
[477]91                // test of pdflog at zero
92                vec zero ( 0 );
[722]93                vec zeron = zeros ( hepdf->dimension() );
[462]94
[502]95                double lpz = hepdf->evallog ( zeron );
[722]96                double lpzc = mEp.evallogcond ( zeron, zero );
[598]97                CHECK_CLOSE_EX ( lpz, lpzc, tolerance );
[502]98
[722]99                vec lpzv ( 1 );
100                lpzv ( 0 ) = lpz;
[502]101
102                mat zero1n ( hepdf->dimension(), 1 );
103                for ( int i = 0; i < zero1n.rows(); ++i ) {
104                        zero1n ( i, 0 ) = 0;
105                }
106
[713]107                vec lpzv_act = hepdf->evallog_mat ( zero1n );
[502]108                CHECK_CLOSE_EX ( lpzv, lpzv_act, tolerance );
109
[722]110                Array<vec> zeroa ( 3 );
111                lpzv = vec ( zeroa.size() );
[502]112                for ( int i = 0; i < zeroa.size(); ++i ) {
[722]113                        zeroa ( i ) = zeron;
114                        lpzv ( i ) = lpz;
[502]115                }
116
[713]117                lpzv_act = hepdf->evallog_mat ( zeroa );
[502]118                CHECK_CLOSE_EX ( lpzv, lpzv_act, tolerance );
[462]119        }
[436]120}
121
[481]122
123void epdf_harness::check_sample_mean() {
[484]124        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
[481]125
126        int tc = 0;
[722]127        Array<vec> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]128        do {
[713]129                mat smp = hepdf->sample_mat ( nsamples );
[481]130                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
[722]131                actual ( tc ) = emu;
[481]132                ++tc;
133        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]134                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( tc - 1 ), delta ) );
[737]135
[481]136        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]137                ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
[481]138                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]139                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
[481]140
[722]141                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]142
143                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]144        }
[481]145}
146
147void epdf_harness::check_covariance() {
148        int tc = 0;
[722]149        Array<mat> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]150        do {
[713]151                mat smp = hepdf->sample_mat ( nsamples );
[481]152                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
153                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
[722]154                actual ( tc ) = er;
[481]155                ++tc;
156        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]157                  !UnitTest::AreClose ( R, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
158
[481]159        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]160                ( !UnitTest::AreClose ( R, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]161                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]162                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << R << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]163
[722]164                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]165
166                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]167        }
[481]168}
169
[722]170void epdf_harness::check_cond_mean ( mprod &mep ) {
[484]171        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
[481]172
173        int tc = 0;
[722]174        Array<vec> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]175        do {
[713]176                mat smp = mep.samplecond_mat ( vec ( 0 ), nsamples );
[481]177                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
[722]178                actual ( tc ) = emu;
[481]179                ++tc;
180        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]181                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( tc - 1 ), delta ) );
[481]182        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]183                ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
[481]184                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]185                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
[481]186
[722]187                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]188
189                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]190        }
[481]191}
192
[722]193void epdf_harness::check_cond_covariance ( mprod &mep ) {
[481]194        int tc = 0;
[722]195        Array<mat> actual ( CurrentContext::max_trial_count );
[481]196        do {
[713]197                mat smp = mep.samplecond_mat ( vec ( 0 ), nsamples );
[481]198                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
199                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
[722]200                actual ( tc ) = er;
[481]201                ++tc;
202        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]203                  !UnitTest::AreClose ( R, actual ( tc - 1 ), tolerance ) );
[481]204        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
[722]205                ( !UnitTest::AreClose ( R, actual ( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
[481]206                UnitTest::MemoryOutStream stream;
[722]207                stream << CurrentContext::format_context ( __LINE__ ) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
[481]208
[722]209                UnitTest::TestDetails details ( *UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false );
[481]210
211                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
[722]212        }
[481]213}
214
215}
Note: See TracBrowser for help on using the browser.