root/library/tests/epdf_harness.cpp @ 493

Revision 493, 7.5 kB (checked in by vbarta, 15 years ago)

fixed UIREGISTER

Line 
1#include "epdf_harness.h"
2#include "base/bdmbase.h"
3#include "base/user_info.h"
4#include "stat/exp_family.h"
5#include "mat_checks.h"
6#include "test_util.h"
7#include "UnitTest++.h"
8#include <memory>
9
10namespace bdm {
11
12void epdf_harness::test_config ( const char *config_file_name ) {
13        RV::clear_all();
14
15        UIFile in ( config_file_name );
16        Array<epdf_harness *> input;
17        UI::get ( input, in, "data", UI::compulsory );
18        int sz = input.size();
19        CHECK ( sz > 0 );
20        for ( int i = 0; i < sz; ++i ) {
21                input ( i )->test ( config_file_name, i );
22        }
23}
24
25void epdf_harness::from_setting ( const Setting &set ) {
26        hepdf = UI::build<epdf> ( set, "epdf", UI::compulsory );
27        UI::get ( mean, set, "mean", UI::compulsory );
28        UI::get ( variance, set, "variance", UI::compulsory );
29
30        UI::get (support, set, "support", UI::optional );
31        UI::get (nbins, set, "nbins", UI::optional );
32        UI::get (nsamples, set, "nsamples", UI::optional );
33        UI::get (R, set, "R", UI::optional );
34
35        mrv = UI::build<RV> (set, "marginal_rv", UI::optional );
36
37        UI::get ( tolerance, set, "tolerance", UI::optional );
38}
39
40void epdf_harness::test ( const char *config_name, int idx ) {
41        CurrentContext cc ( config_name, idx );
42
43        CHECK_CLOSE_EX ( mean, hepdf->mean(), tolerance );
44        CHECK_CLOSE_EX ( variance, hepdf->variance(), tolerance );
45
46        if ( support.rows() == 2 ) {
47                int old_size = nbins.size();
48                if ( old_size < 2 ) {
49                        ivec new_nbins ( "100 100" );
50                        for ( int i = 0; i < old_size; ++i ) {
51                                new_nbins ( i ) = nbins ( i );
52                        }
53
54                        nbins = new_nbins;
55                }
56
57                check_support_mean();
58                check_support_integral();
59        }
60
61        if ( R.rows() > 0 ) {
62                check_sample_mean();
63                check_covariance();
64        }
65
66        if ( mrv.get() ) {
67                RV crv = hepdf->_rv().subt ( *mrv );
68                shared_ptr<epdf> m = hepdf->marginal ( *mrv );
69                shared_ptr<mpdf> c = hepdf->condition ( crv );
70                mepdf mm ( m );
71
72                Array<mpdf *> aa ( 2 );
73                aa ( 0 ) = c.get();
74                aa ( 1 ) = &mm;
75                mprod mEp ( aa );
76
77                check_cond_mean(mEp);
78                if ( R.rows() > 0 ) {
79                        check_cond_covariance( mEp );
80                }
81
82                // test of pdflog at zero
83                vec zero ( 0 );
84                vec zeron ( hepdf->dimension() );
85                for ( int i = 0; i < zeron.size(); ++i ) {
86                        zeron ( i ) = 0;
87                }
88
89                CHECK_CLOSE_EX ( hepdf->evallog ( zeron ), mEp.evallogcond ( zeron, zero ), tolerance );
90        }
91}
92
93void epdf_harness::check_support_mean() {
94        vec xb = support.get_row ( 0 );
95        vec yb = support.get_row ( 1 );
96
97        int tc = 0;
98        Array<vec> actual(CurrentContext::max_trial_count);
99        do {
100                vec emu = num_mean2 ( hepdf.get(), xb, yb, nbins ( 0 ), nbins ( 1 ) );
101                actual( tc ) = emu;
102                ++tc;
103        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
104                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual( tc - 1 ), tolerance ) );
105        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
106             ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
107                UnitTest::MemoryOutStream stream;
108                stream << CurrentContext::format_context(__LINE__) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
109
110                UnitTest::TestDetails details(*UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false);
111
112                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
113       }
114}
115
116void epdf_harness::check_support_integral() {
117        vec xb = support.get_row ( 0 );
118        vec yb = support.get_row ( 1 );
119
120        int tc = 0;
121        Array<double> actual(CurrentContext::max_trial_count);
122        do {
123                double nc = normcoef ( hepdf.get(), xb, yb, nbins ( 0 ), nbins ( 1 ) );
124                actual( tc ) = nc;
125                ++tc;
126        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
127                  !UnitTest::AreClose ( 1.0, actual( tc - 1 ), tolerance ) );
128        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
129             ( !UnitTest::AreClose ( 1.0, actual( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
130                UnitTest::MemoryOutStream stream;
131                stream << CurrentContext::format_context(__LINE__) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
132
133                UnitTest::TestDetails details(*UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false);
134
135                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
136       }
137}
138
139void epdf_harness::check_sample_mean() {
140        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
141
142        int tc = 0;
143        Array<vec> actual(CurrentContext::max_trial_count);
144        do {
145                mat smp = hepdf->sample_m ( nsamples );
146                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
147                actual( tc ) = emu;
148                ++tc;
149        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
150                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual( tc - 1 ), delta ) );
151        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
152             ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
153                UnitTest::MemoryOutStream stream;
154                stream << CurrentContext::format_context(__LINE__) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
155
156                UnitTest::TestDetails details(*UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false);
157
158                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
159       }
160}
161
162void epdf_harness::check_covariance() {
163        int tc = 0;
164        Array<mat> actual(CurrentContext::max_trial_count);
165        do {
166                mat smp = hepdf->sample_m ( nsamples );
167                vec emu = smp * ones ( nsamples ) / nsamples;
168                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
169                actual( tc ) = er;
170                ++tc;
171        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
172                  !UnitTest::AreClose ( R, actual( tc - 1 ), tolerance ) );
173       
174        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
175             ( !UnitTest::AreClose ( R, actual( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
176                UnitTest::MemoryOutStream stream;
177                stream << CurrentContext::format_context(__LINE__) << "expected " << R << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
178
179                UnitTest::TestDetails details(*UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false);
180
181                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
182       }
183}
184
185void epdf_harness::check_cond_mean( mprod &mep ) {
186        vec delta = make_close_tolerance ( variance, nsamples );
187
188        int tc = 0;
189        Array<vec> actual(CurrentContext::max_trial_count);
190        do {
191                mat smp = mep.samplecond ( vec ( 0 ), nsamples );
192                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
193                actual( tc ) = emu;
194                ++tc;
195        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
196                  !UnitTest::AreClose ( mean, actual( tc - 1 ), delta ) );
197        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
198             ( !UnitTest::AreClose ( mean, actual( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), delta ) ) ) {
199                UnitTest::MemoryOutStream stream;
200                stream << CurrentContext::format_context(__LINE__) << "expected " << mean << " +/- " << delta << " but was " << actual;
201
202                UnitTest::TestDetails details(*UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false);
203
204                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
205       }
206}
207
208void epdf_harness::check_cond_covariance( mprod &mep ) {
209        int tc = 0;
210        Array<mat> actual(CurrentContext::max_trial_count);
211        do {
212                mat smp = mep.samplecond ( vec ( 0 ), nsamples );
213                vec emu = sum ( smp, 2 ) / nsamples;
214                mat er = ( smp * smp.T() ) / nsamples - outer_product ( emu, emu );
215                actual( tc ) = er;
216                ++tc;
217        } while ( ( tc < CurrentContext::max_trial_count ) &&
218                  !UnitTest::AreClose ( R, actual( tc - 1 ), tolerance ) );
219        if ( ( tc == CurrentContext::max_trial_count ) &&
220             ( !UnitTest::AreClose ( R, actual( CurrentContext::max_trial_count - 1 ), tolerance ) ) ) {
221                UnitTest::MemoryOutStream stream;
222                stream << CurrentContext::format_context(__LINE__) << "expected " << mean << " +/- " << tolerance << " but was " << actual;
223
224                UnitTest::TestDetails details(*UnitTest::CurrentTest::Details(), 0, false);
225
226                UnitTest::CurrentTest::Results()->OnTestFailure ( details, stream.GetText() );
227       }
228}
229
230}
Note: See TracBrowser for help on using the browser.