% ----------
% Add the following three lines to the preamble:
% \usepackage{multirow}
% \usepackage{dcolumn}
% \newcolumntype{,}{D{,}{,}{-1}}
% ----------
\begin{tabular}{|l||,,|,|}
\hline
& \multicolumn{1}{c}{\multirow{2}{*}{Reference}} & \multicolumn{1}{c}{\multirow{2}{*}{Agenti}} & \multicolumn{1}{|c|}{/Agenti} \\
& \multicolumn{1}{c}{} & \multicolumn{1}{c}{} & \multicolumn{1}{|c|}{/Reference} \\
\hline
Průměrná doba jízdy [s] &  16,88 &  14,68 & -13,0\,\% \\
Průměrné zpoždění [s] &  12,66 &  10,46 & -17,4\,\% \\
Průměrná doba zastavení [s] &  10,06 &   8,53 & -15,2\,\% \\
Počet zastavení [-] &   0,64 &   0,49 & -24,4\,\% \\
\hline
\end{tabular}
% 5.495 - Řevnická (south) - input, left turn